Tento populární a v Americe velmi oblíbený herec a režisér se narodil 19. srpna 1952 v Bethlehemu,
stát Pensylvánie. Zde také vystudoval univerzitu. Ve studiích pokračoval na Harvardu. Několik let
hrál v Loebově dramatickém centru v Massachussetts. Po nějaké době odcestoval do New Yorku.
Než se dostal na Broadway, kde hrál především malé epizodní role, živil se jako číšník.

Od roku 1979 žije v Los Angeles. První velká role přišla se seriálem Lékaři. Následují seriály Vůně
parfému, Papírové panenky, Sever a Jih a nakonec Star Trek: Nová generace. Tento seriálový
fenomén z něho udělal velkou televizní hvězdu. V tomto seriálu hrál od úplného začátku, tj. od
roku 1987. V posledních letech, kdy se Star Trek dostal také na filmové plátno, se Jonathan Frakes
posadil na režisérskou židli a několik těchto filmových příběhů sám režíroval. Režíroval také několik
epizod seriálu Star Trek: Voyager.

Jonathan Frakes také rád píše knihy. V roce 1996 se na knižní pulty dostal jeho román Únosci - Konspirace.

Jeho manželkou je od roku 1988 herečka Genie Francis, kterou poznal během natáčení seriálu Sever a Jih.

Českým divákům je známý také jako průvodce mystery seriálem Věřte - Nevěřte.