Peter Webber studoval na Bristolské Univerzitě. Režíruje dokumenty o tématech zahrnujících jak skladatele Richarda Wagnera, crash test panáky, tak i tvory z hlubokých moří. V roce 2001 natočil kontroverzní minisérii Men Only mapující pokles do světa zločinu a zhýralosti dříve vážených členů futsalového týmu. Před tím, než byl přizván k natočení epizody ze seriálu Six Feet Under (2004), si připsal na své konto drama s názvem The Stretford Wives (2002).

Webberův debut v oblasti celovečerního filmu, Dívka s perlou (Girl With a Pearl Earring, 2003), byl ohromným úspěchem, získal 3 nominace na Oscara, 2 nominace na Zlatý Glóbus a 10 nominací na cenu BAFTA. Film získal řadu ocenění na mezinárodních festivalech včetně cen Hitchcock d’Or a Audience Award na festivalu Dinard Film Festival. Dalším jeho celovečerním filmem se stal snímek Hannibal - Zrození (2007) s Gaspardem Ullielem v hlavní roli.